GENETICS AND GENOMICS
BREEDOMICS: MARKER-ASSISTED BREEDING

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Servizio di Analisi Genomiche per il Miglioramento Genetico
LabGEN – Laboratorio di Genomica c/o DAFNAE

Campus di Agripolis, 01 Aprile 2014

Estrazione e purificazione di DNA genomico totale ad alto peso molecolare

€30 / campione

€115 / 16 campioni

Isolamento di DNA genomico da impiegare per reazioni di restrizione e amplificazione mediante mini-prep

Isolamento di DNA genomico con sistema automatizzato
(96 campioni)

€340 / tessuti vegetali

€185 / tessuti animali

Isolamento di DNA genomico da tessuti animali e vegetali in piastra da 96 campioni (>20 ng/ul, totale 1-2 ug)

Analisi OGM: ricerca di DNA transgenico mediante PCR (Saggio quali-quantitativo)

€82 / campione

€60 / campione (>10)

Analisi del DNA estratto da campioni di alimenti e mangimi per la ricerca dei principali eventi transgenici registrati e presenti in commercio

Mappaggio genetico di caratteri qualitativi (MAS):
8 campioni

€1400 / campione

€2300 / 16 campioni

€3000 / 96 campioni

Selezione genetica di individui con particolari caratteristiche fenotipiche mappando marcatori molecolari associati ai geni corrispondenti

Miglioramento genetico assistito da marcatori (MAB): AFLP fingerprinting (>60 loci)

€270 / 8 campioni

€440 / 16 campioni

€1860 / 96 campioni

Caratterizzazione genetica con marcatori AFLP usando combinazioni di enzimi/primer EcoRI/MseI e PstI/TaqI attraverso analisi elettroforetica capillare

Miglioramento genetico assistito da marcatori (MAB): SSR genotyping (4 loci)

€450 / 8 campioni

€600 / 16 campioni

€1700 / 96 campioni

Tipizzazione genetica mediante marcatori SSR usando loci microsatelliti mappati (neutrali e/o espressi) attraverso analisi elettroforetica capillare

Analisi della struttura
genetica di popolazioni:
8 campioni

€400 / marcatori dominanti

€950/ marcatori co-dominanti

Calcolo indici di diversità genetica e coefficienti di similarità genetica, gradi di omozigosi/eterozigosi,
determinazione di matrici di distanze genetiche, costruzione di alberi NJ e UPGMA, definizione di aplotipi e genotipi

Caratterizzazione genetica di linee parentali (analisi di stabilità e diversità genetica)

€450 / 8 campioni (4 loci)

Analisi dei parametri ACG e ACS in relazione al grado di uniformità genetica entro e diversità genetica tra linee parentali di varietà sintetiche (Syn1) e varietà ibride (F1) utilizzando marcatori SSR mappati: 1 per braccio cromosomico del genoma X della specie

Test DUS di varietà monogenotipiche (linee pure, ibridi F1 e cloni)

€1000 / 24 campioni

Analisi dei parametri DUS ovvero distinguibilità, uniformità e stabilità, necessari per l'iscrizione delle varietà al registro nazionale o comunitario delle varietà di specie agro-alimentari utilizzando marcatori SSR mappati: 1 per braccio cromosomico del genoma X della specie

Tracciabilità genetica di prodotti agro-alimentari (nuDNA haplotyping)

€50 / campione

€220 / 8 campioni

€400 / 16 campioni

Analisi di marcatori SNP di geni nucleari singola-copia per la definizione di aplotipi varietà specifici

Identificazione genetica di specie da matrice organica (cp/mtDNA barcoding)

€50 / campione

€220 / 8 campioni

€400 / 16 campioni

Analisi di marcatori SNP di geni Cox1 e CytB e rbcL e trnH-psbA in matrici agro-alimentari di origine animale e vegetale

Identificazione genetica di specie da matrice organica (Saggio quali-quantitativo)

€160 / campione

€195 / 8 campioni

€280 / 16 campioni

Identificazione genetica di specie in prodotti alimentari di diversa origine a partire da qualsiasi matrice solida e liquida, e relativa quantificazione