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Servizio di Analisi Genomiche per il Miglioramento Genetico delle Varietà e la Tracciabilità Genetica degli Alimenti – Laboratorio di Genomica c/o DAFNAE

Responsabile: Prof. Gianni Barcaccia

Estrazione e purificazione di DNA genomico totale ad alto peso molecolare
€30 / campione
€115 / 16 campioni

Isolamento di DNA genomico da impiegare per reazioni di restrizione e amplificazione mediante mini-prep

Isolamento di DNA genomico con sistema automatizzato
(96 campioni)
€340 /
tessuti vegetali
€185 /
tessuti animali

Isolamento di DNA genomico da tessuti animali e vegetali in piastra da 96 campioni (>20 ng/ul, totale 1-2 ug)

Analisi OGM: ricerca di DNA transgenico mediante PCR (Saggio quali-quantitativo)
€82 /
campione
€60 /
campioni (>10)

Analisi del DNA estratto da campioni di alimenti e mangimi per la ricerca dei principali eventi transgenici registrati e presenti in commercio

Mappaggio genetico di caratteri qualitativi (MAS): 8 campioni
€1400 /
campione
€2300 /
16 campioni
€3000 /
96 campioni

Selezione genetica di individui con particolari caratteristiche fenotipiche mappando marcatori molecolari associati ai geni corrispondenti

Miglioramento genetico assistito da marcatori (MAB): AFLP fingerprinting (>60 loci)
€270/
campione
€440 /
16 campioni
€1860 /
96 campioni

Caratterizzazione genetica con marcatori AFLP usando combinazioni di enzimi/primer EcoRI/MseI e PstI/TaqI attraverso analisi elettroforetica capillare

Miglioramento genetico assistito da marcatori (MAB): SSR genotyping (4 loci)
€450/
campione
€600 /
16 campioni
€1700 /
96 campioni

Tipizzazione genetica mediante marcatori SSR usando loci microsatelliti mappati (neutrali e/o espressi) attraverso analisi elettroforetica capillare

Analisi della struttura genetica di popolazioni:
8 campioni
€400 /
marcatori dominanti
€950 /
marcatori co-dominanti

Calcolo indici di diversità genetica e coefficienti di similarità genetica, gradi di omozigosi/eterozigosi, determinazione di matrici di distanze genetiche, costruzione di alberi NJ e UPGMA, definizione di aplotipi e genotipi

Caratterizzazione genetica di linee parentali (analisi di stabilità e diversità genetica):
€450 /
8 campioni (4 loci)

Analisi dei parametri ACG e ACS in relazione al grado di uniformità genetica entro e diversità genetica tra linee parentali di varietà sintetiche (Syn1) e varietà ibride (F1) utilizzando marcatori SSR mappati: 1 per braccio cromosomico del genoma X della specie

Test DUS di varietà monogenotipiche (linee pure, ibridi F1 e cloni):
€1000 /
24 campioni

Analisi dei parametri DUS ovvero distinguibilità, uniformità e stabilità, necessari per l'iscrizione delle varietà al registro nazionale o comunitario delle varietà di specie agro-alimentari utilizzando marcatori SSR mappati: 1 per braccio cromosomico del genoma X della specie

Tracciabilità genetica di prodotti agro-alimentari (nuDNA haplotyping):
€50 /
campione
€220 /
8 campioni
€400 /
16 campioni

Analisi di marcatori SNP di geni nucleari singola-copia per la definizione di aplotipi varietà specifici

Identificazione genetica di specie da matrice organica (cp/mtDNA barcoding):
€50 /
campione
€220 /
8 campioni
€400 /
16 campioni

Analisi di marcatori SNP di geni Cox1 e CytB e rbcL e trnH-psbA in matrici agro-alimentari di origine animale e vegetale

Identificazione genetica di specie da matrice organica (Saggio quali-quantitativo):
€160 /
campione
€195 /
8 campioni
€280 /
16 campioni

Identificazione genetica di specie in prodotti alimentari di diversa origine a partire da qualsiasi matrice solida e liquida, e relativa quantificazione

Analisi del livello di Ploidia e della dimensione del Genoma:
€150 / campione vs. testimone (3 repliche)
€1000 / 10 campioni (3 repliche)

Determinazione del livello di ploidia (2x, 3x, 4x, ecc.) e della dimensione del genoma (Mpb) di piante mediante citometria a flusso (Flow cytometry, FCM)

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